هکرها «سوپر ماریو ۶۴» را از زمان عرضه آن‌قدر تغییر داده‌اند که اگر یک جستجوی سر انگشتی در گوگل کنید، می‌توانید هک‌ها و بازی‌های عجیب و غریب زیادی پیدا کنید که با دستکاری سوپر ماریو ۶۴ ساخته شده‌اند. جدیدترین دستکاری سوپرماریو ۶۴، بازسازی کامل اولین قسمت سوپر ماریو در موتور این بازی است.