در این نسخه سونیک برای اولین بار دارای یک درخت مهارت پر از توانایی های جدید هیجان‌انگیز و قدرتمند برای یادگیری است. برای باز کردن مهارت‌های جدید، باید آیتم‌های مختلفی را از دشمنان و همچنین در اطراف جزایر بازی جمع‌آوری کنید. سونیک البته مجموعه حرکات استاندارد خود را نظیر Homing Attack ،Drop Dash و Stomp را از همان ابتدای بازی در دسترس دارد. با این حال این حرکات شاید در ابتدا برای مبارزه کافی باشند اما شما باید مهارت‌های جدیدی را کسب کنید.